miRNA 몇 개가 리드를 독차지하면? small RNA-seq 데이터의 정량·정규화·표적 예측 읽는 법
small RNA-seq 분석은 어댑터 자르기와 리드 길이 분포 확인에서 시작하고, 결과는 참조 DB와 판(version)에 따라 달라집니다. miRBase 23판에서는 성숙 miRNA 9,091개의 서열이 바뀌었습니다(대부분 5′·3′ 끝 조정).
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small RNA-seq 분석은 어댑터 자르기와 리드 길이 분포 확인에서 시작하고, 결과는 참조 DB와 판(version)에 따라 달라집니다. miRBase 23판에서는 성숙 miRNA 9,091개의 서열이 바뀌었습니다(대부분 5′·3′ 끝 조정).
small RNA-seq 결과를 가장 크게 흔드는 것은 어댑터 결합 편향입니다. 9개 기관 비교에서 고정 어댑터 키트는 합성 RNA(대부분 miRNA 서열)의 41.6~61.5%를 기대값과 10배 이상 다르게 읽었고, 4N 랜덤 어댑터는 2.8~22.4%였습니다.